Ved Eining for tumorgenomikk nyttar vi arvestoffbaserte teknikkar, altså analysar av DNA og RNA, for å diagnostisere sjukdom.
Små mengder arvestoff vert isolert frå vevsprøver som er innsende til Avdeling for patologi. Ved hjelp av teknikken PCR kopierer vi opp det området av DNA-molekylet som er interessant, og deretter vert dette undersøkt for genfeil (mutasjonar). For å synleggjere mutasjonane nyttar vi metodar som gel-elektroforese, sanntids-PCR og DNA-sekvensering.
Arbeidet ved laboratoriet vårt er i første rekke knytt til kreftdiagnostikk. Prøvesvara kan seie noko om pasienten har kreft eller ein godarta tilstand, kva type kreft pasienten eventuelt har, og kva behandling han/ho i så fall bør få. Ikkje minst har det dei siste åra vore ein stor auke i analysar som avgjer bruk av nye, målretta medikament i behandling av visse typar svulstar.
Ved Eining for tumorgenomikk arbeidar bioingeniørar, molekylærbiologar, professor og patologar. Vi har tett samarbeid med Avdeling for patologi, og jobbar i hovudsak med følgjande problemstillingar:
- PCR, fragmentanalysar, Sanger-sekvensering og djupsekvensering (NGS) av kreftsvulstar for å sjå på genetiske endringar på nukleinsyrenivå.
- Multipleks digital kvantifisering (Nanostring) av RNA-uttrykk hjå kreftsvulstar for å sjå på genetiske endringar på nukleinsyrenivå.
- Fluorescens in situ hybridisering (FISH) av kreftsvulstar for å sjå på genetiske endringar på kromosomnivå.